1964'e kadar Art Blakey ile Jazz Messengers grubunda çalmiştir. Art Blakey ile yaptığı çalışmalarla dikkatleri üzerine çekmiştir.Miles Davis’in beşlisinde George Coleman’ın yerini almıştır. Juju, Speak No Evil, All Seeing Eye, The Soothsayer, Adam’s Apple ve Night Dreamer gibi albümlerle caz tarihinde önemli bir yere sahip olan Shorter, 1968 de ise Avusturyalı orgcu, piyanist Joe Zawinul ile Wheather Report grubunu kurmuştur. Bu grupla birlikte Black Market, Heavy Wheather, Mr Gone gibi pek çok albüm çıkardı.

2004 yılında çıkardığı Alegria albümü ile Grammy ödülünün de sahibi olmuştur.